La Fédération Générale des Pupilles de l'Enseignement Public est composé d'un siège fédéral et de 97 associations départementales regroupées en 22 unions régionales.
Comme l'ADPEP 76, chacune des associations gère des établissements et services dans différents domaines d'intervention (centres d'accueil de classes de découverte, centres de vacances, centres de loisirs, établissements sociaux et médico-sociaux, SAPAD...)
Actuellement et depuis 2010, la Fédération des Pupilles est présidée par Joël DERRIEN.